Institut Méditerranéen d’Océanologie
Accueil du site > Agenda > Congrès nationaux et internationaux > Institut Français de Bioinformatique : 6ème Ecole de Bioinformatique (...)

Institut Français de Bioinformatique : 6ème Ecole de Bioinformatique Aviesan

Version imprimable de cet article

Institut Français de Bioinformatique (IFB) et l’ITMO Génétique, génomique et bioinformatique (GGB) d’Aviesan organisent, avec la contribution des plateformes de l’IFB, la

6ème Ecole de Bioinformatique Aviesan-IFB (EBAI17)
Initiation au traitement des données de génomique obtenues par séquençage à haut débit

Date : du dimanche 12 novembre (18h) au vendredi 17 novembre (14h) 2017,
Lieu : Station Biologique, Roscoff.

Objectifs : la formation s’adresse à des chercheurs et ingénieurs directement impliqués dans des projets “Next Generation Sequencing” (NGS). Cette édition de l’école s’adresse aux nouveaux enjeux technologiques : elle inclura notamment une ouverture aux technologies lectures longues, qui transforment les approches en matière d’assemblage de génomes et l’identification de transcrits pleine longueur, ainsi que trois ateliers optionnels (lectures courtes : RNA-seq, ChIP-seq, variants), et une introduction à l’intégration des données. L’école vise à introduire les concepts et à manipuler les outils informatiques qui permettront aux participants d’analyser ensuite leurs propres données de séquençage. Elle sera basée sur une alternance de courtes sessions théoriques et d’ateliers pratiques. Les participants bénéficieront d’un tutorat personnalisé pour discuter de leur plan d’analyse, et effectuer les premières étapes de traitement de leurs propres données ou de celles de leur plateforme.

Points d’attention
==============

1. Cette formation n’a pas pour vocation de réaliser l’analyse complète des données des participants. Le tutorat vise à fournir un encadrement personnalisé pour concevoir les pipelines d’analyse et interpréter les premiers résultats.

2. La formation a évolué par rapport aux sessions précédentes afin de s’adapter à l’évolution des besoins et des technologies. L’ensemble de la formation reposera sur l’utilisation de commandes en ligne (terminal Linux) pour les analyses bioinformatiques, et du langage R pour les analyses statistiques. Elle s’adresse principalement à des biologistes, et la participation ne nécessite pas de formation préalable en Linux ou R.

Programme et modalités pratiques
============================

- Site Web : https://www.france-bioinformatique.fr/EBA2017

- Modalités d’inscription : compléter en ligne la fiche de demande d’inscription : (onglet "Demande d’inscription")

- Date limite pour les demandes d’inscription : *** 19/05/2017 ***

- Frais (hébergement et repas inclus) :
- pour les personnels académiques 500 €HT = 600 €TTC
(coût déjà couvert pour les personnels rémunérés par l’Inserm)
- pour les industriels : 1750 €HT = 2100 €TTC.

Sélection des participants : mi-juin 2017. La sélection des candidatures reposera sur l’évaluation de l’adéquation entre la formation et les projets d’analyse de données décrits par les candidats dans la fiche de demande d’inscription.

Contact : ecole-bioinfo@aviesan.fr

Voir en ligne : http://www.france-bioinformatique.f...